红塔证券股份有限公司是在对云南省三家信托投资公司（云南省国际信托投资公司、云南金旅信托投资有限公司、昆明国际信托投资公司）证券业务重组的基础上，由红塔集团等13家国内知名企业共同发起，并经中国证监会批准设立的综合类证券公司。2002年1月31日，公司在云南省工商行政管理局领取了《企业法人营业执照》。2002年3月23日，公司正式开业。2007年12月21日，公司股东由13家变更为8家。2007年5月11日，经中国证券业协会评审，公司成为西南地区首家创新试点类证券公司。2015年7月，晋升为A类A级证券公司。2015年7月28日，公司注册资本增至32.69亿元人民币，公司股东变更为12家。2015年12月23日，公司股东变更为11家，云南合和（集团）股份有限公司成为公司第一大股东。
公司按照《公司法》、《证券法》等法律、法规的要求，建立了规范的法人治理结构，形成了股东大会、董事会、监事会和经理层权责明确、各司其职、协调运转、有效制衡的机制。股东大会是公司的权力机构，董事会是公司的决策机构，对股东大会负责；董事会下设发展战略委员会、提名及薪酬委员会、审计委员会和风险控制委员会四个专门委员会；监事会是公司的监督机构，对股东大会负责；经理层是公司的执行机构，对董事会负责；经理层下设证券自营业务投资决策委员会、资产管理业务投资决策委员会、风险管理委员会、融资融券业务决策委员会、投资银行业务内核小组、场外市场业务内核小组六个专业委员会。公司总部设有16个职能部门，下辖38家营业部、1家分公司（上海分公司）、3家全资子公司（红塔期货有限责任公司、红证利德资本管理有限公司、红正均方投资有限公司）、1家控股子公司（红塔红土基金管理有限公司）。
